The Valley of the Architects повествует об экспедиции писательницы Лизы по Африке, цель которой — раскрыть секреты потерянного Архитектора. Героиня преодолевает череду испытаний, манипулируя окружением и применяя лифты как единственный способ передвижения. Эти головоломки были созданы загадочной фигурой, известной как Архитектор Q. Решение каждой задачи продвигает Лизу вперед, постепенно разворачивая историю, проверяющую ее решимость и навыки в череде абстрактных трехмерных диорам.

Повествование в The Valley of the Architects разворачивается на страницах статьи Лиз для журнала Architectural Abstract. Путешествие героини полностью озвучено, а каждый игровой уровень представляет собой новую страницу издания, зачитываемую вслух. Эта игра начинается как рассказ об архитектуре, но перерастает в повесть о выживании и открытиях. Лиз рискует репутацией журнала, отправляясь в опасные локации и преодолевая вызовы, оставленные много лет назад таинственным зодчим.

Основной геймплей завязан на манипулировании элементами каждого уровня, чтобы помочь Лизе перемещаться по локациям с помощью лифтов. По ходу прохождения загадки усложняются, а их структура обрастает новыми деталями в сравнении с начальными тестами. Установленные правила постоянно меняются, бросая вызов способностям геймера. Такая система заставляет адаптировать тактику к меняющимся условиям и ограничениям каждого последующего этапа, что требует от игрока постоянной сообразительности.