Deadly Premonition: The Director's Cut предлагает геймеру примерить роль специального агента Фрэнсиса Йорка Моргана, знакомого большинству как Йорк. Ему предстоит провести дознание по серии происшествий, известных как Убийства Красного Семени, в уединенном американском горном поселении. Миссия включает столкновение со сверхъестественными созданиями и таинственной личностью в плаще, вооруженной топором; оба стремятся воспрепятствовать его попыткам раскрыть это дело. Данная версия привносит новые аспекты в первоначальный игровой процесс.

Сюжет Deadly Premonition: The Director's Cut развивается по мере того, как Йорк изучает обстоятельства жестокой гибели молодой местной жительницы в поселении Гринвейл. Этот проект с открытым миром, расположенный среди гор и в небольшом американском пригороде, знакомит с многочисленными персонажами для взаимодействия и предлагает уникальные локации для изучения. Посредством выполнения второстепенных заданий и участия в мини-играх, игроки получают возможность глубже вникнуть в детали этих преступлений. Такая деятельность также помогает обнаружить самые сокровенные тайны Гринвейла.

Эта версия Director's Cut содержит новый сюжетный поворот, созданный режиссером тайтла, Хидэтакой Swery Суэхиро. К тому же, она включает измененную систему управления, разработанную для совершенствования боевых взаимодействий. Данный релиз углубляет основную загадку за счет дополнительного материала, выходящего за пределы первоисточника. Ключевые механики сочетают составляющие напряженного хоррора с элементами приключенческого боевика, пока персонаж продвигается по сюжету.