Aethernaut – это довольно сложная головоломка, в которой игрок окажется в мире стимпанка и удивительных механизмов. Понимать принципы их работы, и на какие рычаги нажимать предстоит методом проб и ошибок. Благо протагониста здесь никто не преследует и нападать не собирается, так что можно спокойно сосредоточиться на задаче и уделить ей столько времени, сколько потребуется.

Мужчина просыпается в неизвестном для него месте и не понимает, как сюда попал. Внезапно голос из приемника сверху заставляет его вздрогнуть. Его приветствует ученый Корнелла, который поясняет, что это место называется Конструктор и состоит из множества комнат. Протагонист был отобран по программе для проведения эксперимента, на который он сам же и подписался, хотя о таком совсем не помнит. Ему необходимо будет пробраться через этот лабиринт к Ядру и тогда его отправят домой. Чтобы тот не заскучал, его везде будет сопровождать исследователь, и при этом задавать странные философские вопросы. В зависимости от ответов поведение диктора может меняться, как и некоторые миссии.

Постепенно, проходя уровни Аетернаут, игрок начнет слышать странный тонкий голос, молящий о помощи. Протагонист решает скрыть это явление в секрете, чтобы лично исследовать причину его появления. Возможно, комплекс скрывает в себе куда больше секретов, чем кажется с первого взгляда. Кроме того, парень все еще желает выяснить, как именно попал сюда, и не было ли это похищением.