В Wetlands виртуальный мир, с развитым сюжетом, который позволит насладить определенной атмосферой при прохождении. Действия происходят в 2495 году, когда валаранцы совершили нападения на планетарные колонии. Филип Надж – ученый, который со временем стал преступником и погрузился в криминал. Его освободили от колонии Альфа 16. Основная цель - это вернуть Наджа к жизни. Протагонист Джон Коул, был назначен на выполнение миссии генералом Корбеттом, поэтому должен выполнить все по высшему разряду.

После борьбы с врагами Колу все же удалось прилететь на Землю, где будет проводиться исследование на базе Омикрон. Ему показывают станцию на синем секторе, где нашли агента федерации. После удачного побега от местных наемников, Коул покидает станцию и направляется в место, где было совершенно убийство. Прибыв к месту назначения, он находит тело Наджа, убитого выстрелом в затылок. После этого главный герой начинает расследование вместе с девушкой Кристин. Но неизвестно, насколько запутано это дело. Игры имеет рисовку в аниме-стиле. Wetlands имеет 20 уровней и на каждом уровне разные испытания, новые враги. Геймер может, управляя персом, передвигать расположение камеры вправо и влево, для того чтобы лучше видеть противников. В некоторых случаях можно использовать разный путь, но на таких уровнях нужно выстрелить по всем нужным объектам, которые могут быть спрятаны в темных уголках карты.