Project Wunderwaffe - стратегия, позволяющая строить базу во времена Второй мировой. Игрок получает приказ о том, что необходимо построить секретную подземную базу, которая должна заняться разработкой мощного оружия, способного переломить ход войны. База выступает последним бастионом в том, чтобы вырвать победу у Советского Союза. Пока идет война на передовой, лучшие умы страны занимаются разработкой оружия массового поражения.

Чтобы станция функционировала, требуется провести электричество, воду, обеспечить чистый воздух и т.д. Представлено множество основных и второстепенных заданий, которые помогают получать ресурсы и деньги. Необходимо строить лаборатории, операционные центры, шпионские будки, испытательные помещения, тиры и другие комнаты, прокачивающие способности юнитов. В Project Wunderwaffe можно расширять базу вдоль и вширь. Важно устанавливать одинаковые постройки рядом друг с другом, чтобы увеличивать их мощь.

Очень важно выделить пространство для хранения химического и ядерного оружия. Однако их не стоит строить рядом с тиром, потому что это приведет не к самым лучшим последствиям. Требуется создавать разведывательные группы, отправляя их на поверхность для добычи ресурсов. В свои ряды необходимо набирать ученых, военных, шпионов, агентов и т.д. Позволяется разработать лазер, орбитальную пушку, невидимый транспорт, летающие шаттлы и т.д. Можно создать ядерную бомбу, которая способна посеять настоящий хаос в мире - все зависит лишь от самих игроков. Доступны различные боеприпасы, оружие, броня, технологии и т.д. Стоит опасаться разведчиков со стороны Союза. Также требуется считаться с временем и действовать как можно быстрее, поскольку враг не дремлет!