Mutation Nation погружает юзеров в антиутопическое будущее, где царит хаос после того, как безумный ученый выпустил на волю чуму мутантов. В этой обстановке геймеры берут на себя роли Рики Джонса и Джонни Харта, двух персонажей, которых чума не коснулась. Они перемещаются по различным локациям, среди которых трущобы, кишащие мутантами, шумные городские улицы и жуткая лаборатория ученого. Каждая из этих локаций представляет собой уникальные трудности и врагов, что создает динамичную атмосферу игры. Всеобъемлющее повествование служит фоном для разворачивающихся событий.

Механика Mutation Nation основана на классической формуле beat 'em up, где геймеры сталкиваются с волнами врагов, используя набор ударов, пинков и специальных приемов. Управление обеспечивает плавность боя, позволяя проводить быстрые комбо, что делает действие увлекательным. Юзеры могут пройти игру в одиночку, но объединение с другом открывает другой уровень стратегии и удовольствия. Кооперативный аспект придает глубину, превращая ее в социальный опыт, когда юзеры вместе пытаются справиться с угрозой мутантов.

Кроме того, тут есть такие режимы, как Hi Score и Caravan, дающие геймерам стимул совершенствовать свои навыки и соревноваться за более высокие места в рейтинге. По мере прохождения уровней юзеры сталкиваются с разнообразными противниками, для победы над которыми требуются различные тактики. Разнообразие типов врагов позволяет сохранить свежесть боя, а некоторые противники используют уникальные схемы атаки.