Jin and Jan предлагает особую механику управления, где геймер руководит двумя персонажами одновременно. Один протагонист, Джин, повторяет команды напрямую, тогда как второй, Ян, совершает противоположное действие на каждый ввод. Необходимо предвидеть последствия каждого шага для навигации по локациям, уклонения от опасностей и обхода противников.

Основная задача заключается в перемещении обоих братьев к центральной точке карты для проведения особого ритуала, призванного восстановить равновесие. Геймплей в Jin and Jan строится вокруг этой системы двойного инверсного контроля в рамках повествования, где неосторожные действия разделили мир на Светлую и Тёмную половины. Призрачные братья отправляются в приключение, сочетающее решение головоломок с навигацией, основанной на навыках, чтобы воссоединить расколотую реальность.

Тщательное планирование становится критически важным, поскольку враги по-разному реагируют на перемещения: некоторые оппоненты действуют в реальном времени, в то время как другие меняют позицию только после хода персонажей, добавляя стратегический аспект в прохождение. Юзерам предстоит преодолеть 45 уникальных этапов, каждый из которых ставит всё более сложные задачи, требующие координации и предусмотрительности. Хотя управление в этом проекте представлено просто, достижение мастерства включает обучение предсказанию противоположных движений Яна и использование его противодействия для выработки успешных стратегий. Преодоление препятствий на каждом уровне даёт понимание, необходимое для эффективного обращения с парой персонажей.