Mystic Explorer – это игра в жанре treasure rogue, где игроки выступают в роли охотников, ищущих сундуки с сокровищами. Ключевая задача — пережить осады чудовищ, собирая добычу и одолевая всё более сильных противников. Сессия делится на два этапа: начальная 10-минутная фаза развития, сменяющаяся 10-минутным испытанием. Лишь геймер, выдержавший финальную стадию, способен забрать с собой собранные архивные ценности.

Игровой процесс в Mystic Explorer строится на применении разнообразного арсенала. Вооружение классифицируется по типам, включая средства ближнего, дальнего боя и метательные снаряды, обладая при этом физическими или магическими свойствами. Особые категории, вроде дикости, крови и молнии, определяют стили атак, предлагая различные тактики ведения боя. Модернизация вооружения даёт очки усиления и может добавлять особые эффекты, причём некоторые из них взаимодействуют с другим снаряжением или повышают параметры персонажа на основе имеющихся статов.

Достижение определённого уровня мастерства открывает доступ к навыкам, дополняющим сборку персонажа. Одни умения усиливают конкретный класс вооружения, другие обеспечивают постоянный рост показателей, а третьи конвертируют один параметр героя в другой. Искатели приключений отыскивают на карте ларцы с добычей, охраняемые монстрами, и вступают в бой за право их открыть. Наиболее ценные хранилища требуют больше времени на вскрытие, заставляя противостоять врагам нарастающей мощи ради получения уникальной награды.