Zerion 12 — стратегическое командование последним оплотом человечества на одноименной планете в 2184 году. После разрушения Земли остатки цивилизации прибывают в новый мир, который оказывается враждебной территорией, захваченной инопланетной расой Зектидов. Главная задача — обеспечить выживание колонистов, для чего необходимо методично зачищать поверхность планеты от агрессивных ксеноморфов.

Противостояние разворачивается по секторам, где каждое сражение становится проверкой тактических навыков и умения адаптироваться к постоянно меняющимся угрозам со стороны безжалостных пришельцев, наступающих волнами. Процесс обороны требует грамотного управления ресурсами, необходимыми для возведения, ремонта и улучшения футуристических оборонительных сооружений. В арсенале командира представлен широкий ассортимент башен как атакующего, так и защитного назначения, позволяющих выстраивать многоуровневую защиту от полчищ Зектидов.

Каждая битва в Zerion 12 проходит в режиме реального времени, заставляя оперативно реагировать на выпады противника, среди которых встречаются не только рядовые особи, но и могущественные боссы. Стратегическая глубина проекта дополняется необходимостью планировать развитие своей базы и предугадывать действия врага на 12 уникальных секторах планеты. Чтобы успешно противостоять инопланетной угрозе, предстоит тщательно изучать сильные и слабые стороны различных типов врагов. Одни Зектиды могут обладать высокой скоростью, другие — мощной броней, что требует применения разных видов вооружения для их эффективного уничтожения.