PixelJunk Eden 2 — гипнотическое приключение, в котором крошечные существа, известные как Гримпы, отправляются в путешествие по постоянно меняющимся психоделическим садам. Основная задача этих созданий заключается в поиске и сборе Спектры — эссенции жизни, необходимой для спасения их мира от увядания. Перемещаясь по сюрреалистичным ландшафтам, Гримпы используют шёлковую нить, чтобы раскачиваться, прыгать и цепляться за причудливую флору.

Каждый сад представляет собой уникальную экосистему с неповторимыми растениями и препятствиями, а главной целью на каждом уровне является активация семян, которые распускаются новыми путями, открывая доступ к источникам драгоценной Спектры. Динамичный саундтрек, созданный художником и музыкантом Baiyon, реагирует на действия персонажа, создавая уникальную аудиовизуальную симфонию. Процесс исследования в PixelJunk Eden 2 тесно связан с ростом местной флоры. Собирая пыльцу с растений, Гримпы стимулируют их рост, что позволяет добраться до ранее недоступных участков.

Этот платформер предлагает не только одиночное прохождение, но и локальный кооперативный режим для двух участников, где можно совместно исследовать красочные миры. Для изменения впечатлений от прохождения предусмотрены специальные модификаторы, именуемые специями. Они позволяют настраивать визуальные эффекты и некоторые аспекты геймплея, делая каждое погружение в сады неповторимым. Например, одна специя может изменить цветовую палитру уровня, а другая — повлиять на поведение Гримпа, добавляя новые испытания или упрощая навигацию по витиеватым лабиринтам из стеблей и листьев.