Alone in the War относится к изометрическим шутерам. В инди-проекте нетипичное управление. Для прицеливания нужно зажать левую кнопку мыши одновременно с правой. За передвижение отвечают клавиши W, A, S, D на клавиатуре. Ещё герой может переключаться между пушками, перезаряжать и прятать их, приседать, бросать гранаты. Для удобства ориентирования на местности в левом верхнем углу экрана имеется карта. Её можно масштабировать. Контролировать ракурс камеры нельзя. Она всегда находится под одним углом.

Кампания состоит из 15 уровней. Для завершения этапа нужно отыскать и перебить всех противников на локации. В Alone in the War скромный арсенал: начальный пистолет, дробовик и штурмовая винтовка. Два последних оружия открываются постепенно по мере прохождения. За выполнения миссий иногда дают дефицитные патроны к ним. Можно проходить задания повторно, чтобы с помощью гринда накопить амуницию в достаточном количестве. Других способов восполнить боезапас нет.

Стволы разрешают прокачивать. Можно улучшить урон, скорострельность, количество патронов в магазине и скорость перезарядки для каждой разновидности вооружения. Апгрейды покупаются за монетки. Золото просто разбросано по карте. Полноценного сюжета нет. Согласно короткой завязке, единственный агент пытается уничтожить армию солдат.