Chuusotsu! 1st Graduation: Time After Time – это интерактивный рассказ, показывающий приключения трех милых девчонок. Визуальное оформление выполнено в анимешной стилистике, а геймплей представляет собой классическую новеллу, где пользователи будут переключать иллюстрации на экране и читать диалоги между персонажами. В процессе прохождения, будет доступна возможность совершать выборы в определенных ситуациях, сказывающихся на продолжении нелинейного сюжета.

Сюжетная линия в Chuusotsu! 1st Graduation: Time After Time повествует про фанатку манги, которую зовут Марисугава Аруэ. Девушка страдает от неизлечимой болезни и понимает, что должна провести свою жизнь в роли "тюусоцу", не получив должного образования после средней школы. При жизни такие личности считаются неудачниками, потому что не обладают никакими печатями и документами, позволяющими устроиться на отличную работу или занять желаемую должность на фирме в будущей взрослой жизни.

Чтобы исправить сложившуюся ситуацию, девчонка находит объявление с помощью для подобных граждан. В качестве поддержки, организация подселяет протагонистку к двум другим девушкам, страдающих от подобных проблем. Проживая вместе под одной крышей, необходимо проходить бытовые испытания и учиться выполнять групповые задания, рассчитанные на адаптацию в обществе и полноценное благоустройство.