В The Crystal Key используется один из классических вариантов сюжета. Так, пришельцы, внезапно появившиеся на орбите Земли, начинают готовиться к полномасштабному вторжению. Во главе их армии стоит некий Озгар. Из-за воздействия спутников инопланетного происхождения Земля перестала быть пригодной для существования. И теперь, покинув её, человечество обнаруживает отдаленную планету с пригодными для жизни условиями. Здесь хранится кристальный ключ, который ни при каких обстоятельствах не должен попасть в руки злодея, иначе это приведет к неминуемым последствиям. Поэтому, помимо спасения и восстановления Земли необходимо также дать отпор Озгару.

Игровой процесс The Crystal Key основывается на базовых механиках системы point and click. Так, у персонажа имеется определенный участок пространства, в рамках которого он может двигаться. С учетом того, что все подается от первого лица, угол обзора ограничен, и нужно постоянно двигать курсор в стороны, чтобы искать нужные предметы. Так, кликая на доступные объекты, можно сразу же запустить процесс использования, или просто поместить тот или иной предмет в инвентарь, чтобы найти ему применение в дальнейшем. Например, в одном из сегментов необходимо поставить книги на полку в башне замка, чтобы открыть потайную дверь и пройти на следующую локацию. А с учетом того, что все это сопровождается нагнетающей мелодией, геймеры буквально ощущают себя заложниками ситуации. Более того, в игре практически отсутствует входящая информация в виде текстов, диалогов, записей и прочего. Все подается исключительно за счет действий и кат-сцен, которые и формируют сюжет.