Mercenary Squad Auto Chess предлагает игровой процесс в жанре roguelike auto chess, где развитие сосредоточено на снаряжении. Геймеры нанимают бойцов из четырех доступных профессий, формируя уникальный отряд для отправки в битву. Затем юниты размещаются на поле, где автономно вступают в схватку с монстрами до полного уничтожения одной из сторон. Уничтожение противников приносит новые предметы, которые служат основным ресурсом для усиления и создания коллектива с высокой боевой эффективностью. Ключевая механика этого проекта завязана на цикличном участии в поединках для получения добычи и планомерного совершенствования возможностей группы для будущих вызовов.

В Mercenary Squad Auto Chess основной акцент сделан на менеджменте ресурсов и подготовке отряда перед каждой схваткой. Геймплей заключается в перетаскивании наемников на поле боя, после чего поединок начинается без непосредственного вмешательства игрока. Полученные за сражения монеты тратятся на апгрейд магазина для вербовки или на прямой наем свежих бойцов. В случае неудачи дальнейшее продвижение требует усиления мощи группы за счет экипировки более качественных вещей или улучшения параметров уже имеющихся. Финальная задача — собрать несокрушимую команду путем непрерывного цикла развития и апгрейда экипировки.