Cave Crusade предлагает детально проработанную структуру карточного рогалика, рассчитанную на динамичные и быстрые игровые сессии. Геймеры активно изменяют состав своей колоды и методично отыскивают мощные артефакты в ходе многочисленных приключений. Ключевая система реликвий, которая содержит как активные, так и пассивные предметы, позволяет находить эффективный выход из самых различных ситуаций. Такой продуманный подход целиком ориентирован на планомерное улучшение карточек и систематический сбор ценных предметов для значительного продвижения персонажа.

Проект Cave Crusade внедряет механику Колеса Фортуны. Игрок вращает его, чтобы получить шанс на золото, очки здоровья или случайный артефакт из своей текущей коллекции. Исходы обычно приносят ресурсы или предметы, хотя проклятия также являются возможным результатом. Приходится принимать все карточки и артефакты, полученные с колеса, а возврат монет от вращения может быть меньше его стоимости. Первое вращение на каждом событии повышает качество следующего Колеса до эпического уровня, после чего оно сбрасывается.

Перемещение по миру реализовано через систему Карты Узлов в данной игре. При каждом новом заходе эта карта создается с особым расположением узлов, формируя цепочку локаций. Данные места содержат обычные стычки, элитные баталии и сражения с боссами. На карте также расположены точки для отдыха, лавки с опцией обновления ассортимента, места для нахождения сокровищ и новые события. Возможно возникновение нескольких событий подряд, что позволяет продвигаться быстрее.