Luxor: Pharaoh's Challenge ставит перед геймерами задачу уничтожить цветные сферы, собрав три и более одинаковых цвета. Игроки используют крылатого скарабея, чтобы стрелять в дополнительные сферы, заставляя их сталкиваться и взрываться в цепной реакции. Задача состоит в том, чтобы не допустить попадания сфер в пирамиду игрока, что приводит к потере жизни. Завершение уровня предполагает уничтожение определенного количества шаров до того, как они достигнут пирамиды.

Содержится 88 уровней с нарастающей сложностью и 13 бонусных раундов. Игроки могут выбирать различные настройки соотвествующие своему скиллу, при этом за более высокие сложности начисляются самые высокие баллы. "Сюжетный режим" позволяет геймерам разблокировать титулы и рейтинги по мере продвижения кампании. Структура локаций построена по определенной схеме: порядок уровней повторяется через каждые три этапа, и каждый раз добавляется дополнительный бонус-левел.

Поскольку Luxor: Pharaoh's Challenge оригинальной части, добавлены различные нововведения: новая сюжетная линия и названия сцен., удалена сложность Challenge of Horus. Присутствует набор значков и достижений, а также 13 благословений для улучшения геймплея и множество других как крупных, так и мелких дополнений, в значительной степени расширяющие игровые возможности оригинала.