Wretched Depths предлагает геймеру вжиться в роль Сэм, преданной энтузиастки рыбалки, которую привлек уединенный регион Твин Пайнс. Ее конкретная цель заключается в забросе удочки в загадочное озеро Империум, обширный водоем, полный тайн и местных легенд. Практически сразу после прибытия, пока герой осваивается на новом месте, вокруг нее часто начинают происходить необычные и необъяснимые события. Малочисленные обитатели поселения ведут себя нетипично, иногда пугающе, а существа, пойманные в озере, демонстрируют явные отклонения от нормы.

Изучение локаций и интеракция с окружением постепенно приоткрывают завесу над всеобщей аномальностью этих краев. Основной геймплей в Wretched Depths строится вокруг динамичной системы ловли, предлагая испытать механики выуживания разнообразных водных обитателей. Сэм использует эту добычу, реализуя ее для получения средств на покупку продвинутого снаряжения и необходимых припасов. Такое улучшение экипировки открывает доступ к более глубокому изучению ранее недостижимых зон внушительных глубин озера Империум.

Спуск сопряжен с неопределенностью, ведь водоем скрывает тайны далеко под поверхностью, а погружение в неизведанное ставит вопрос: что же обитает на самом дне? Управление находками и инструментами происходит через понятную сеточную систему инвентаря параллельно с апгрейдом оснащения. Здешнее окружение населено популяциями различных видов созданий, что дает шанс на открытия и сбор коллекции во время пребывания у водоема. Столкновения с непредвиденным сопровождают путешествие, случаясь регулярно, пока герой перемещается по Твин Пайнс и акватории озера Империум.