Kinoko ставит геймера в роль лесного духа с единственной целью — преобразить ландшафт из зимнего в весенний. Геймплей включает прямое взаимодействие с миром для содействия этой смене сезонов. Геймеры активно убирают снег в разных зонах и отвечают за посадку цветов, наблюдая, как их усилия напрямую влияют на местность. Окружение заметно откликается на эти старания, показывая признаки обновления, пока персонаж перемещается по различным локациям с видом от третьего лица. Этот процесс формирует ядро игрового опыта, фокусируясь на изменении среды, связанной с природными циклами.

В Kinoko дальнейшее прохождение требует выполнения конкретных поручений, расположенных в отдельных участках местности. Руководство по этим необходимым активностям исходит от четырех персонажей-помощников, представленных в начале тайтла на специальном обучающем острове, что гарантирует понимание целей перед тем, как углубиться дальше. Успешное выполнение этих обязанностей приводит к активации каменных столбов, служащих воротами, контролирующими доступ к новым частям мира. Это поэтапное продвижение ведет геймера через контент игры линейным образом.

Структура проекта подчеркивает краткость; он предназначен для завершения примерно за 15 минут от старта до финала. Следовательно, игра не включает функцию сохранения, требуя от геймеров проходить путешествие за одну непрерывную сессию. Такой дизайн поощряет сфокусированное взаимодействие в рамках отведенного времени, представляя собой завершенную последовательность заданий, ведущих в конечном итоге к финальному переходу локаций от их зимнего состояния. Прохождение разворачивается как непрерывный поток активностей без точек прерывания.