EON Fighter — это экшен-игра с видом сверху с roguelite-системами, где игрок пилотирует истребитель через враждебные сектора космоса. Геймплей сосредоточен на столкновении с непрерывными волнами оппонентов и сборе ресурсов для продвижения. В роли последнего представителя человечества необходимо выполнять задания, противостоя постоянному неприятелю. Структура жанра shoot 'em up требует непрерывного движения и тактической смекалки для выживания в условиях натиска. Ключевая цель — выполнение поставленных заданий и сдерживание штурма.

Геймплей EON Fighter сталкивает одинокий корабль с сотнями одновременных противников, создавая на экране настоящий bullet hell. Геймерам предстоит действовать в замкнутых зонах, маневрируя для выбора позиции и сбора ключевых для миссии ресурсов. Атаки врага не прекращаются, представляя собой постоянную проверку рефлексов пилота и тактических навыков. Выживание зависит от способности игрока управлять задачами под огнем с нескольких векторов. Полное уничтожение всех врагов является условием для дальнейшего продвижения.

На выбор доступны 8 истребителей с различными характеристиками, служащие основой для создания сборок. Эти боевые машины можно улучшать посредством 12 отдельных систем апгрейда, а также десятков видов вооружения и специального оборудования. Этот проект предлагает бесконечное число комбинаций для кастомизации своего судна. Такой путь развития ведет пилотов в самые отдаленные уголки космоса. Там их ждет столкновение с вражеским Боссом, требующее прорваться через шквал снарядов для уничтожения цели и выполнения финального задания.