Завоевание: Пограничные войны – стратегия в реальном времени, действия которой происходят на орбитах планет любой системы. Игрок может устанавливать линии снабжения между дальними участками галактики, чтобы быстро перемещаться и применять все возможности разных космических тел. Единица снабжения – основной ресурс, требующийся для работоспособности кораблей, специальных устройств и оружия.

Сюжетная кампания состоит из последовательных миссий с кат-сценами и видеороликами. На старте сценарного режима пользователь берёт управление над адмиралами – героями, переходящими из одной миссии в другую. По мере продвижения открывается доступ к большему числу улучшений, изменению экипировки и добавлению разных навыков. В быстро матче адмиралы представлены в виде лидеров флота со стандартной прокачкой. Расы в Conquest: Frontier Wars:

• Человечество – единственная нация из представленных, которая сражается между собой. Даже после многочисленных технологических исследования и межзвездных перелетов они продолжали конфликтовать. После последней битвы, земляне стали более или менее объединенными, не устраивая глобальных войн.
• Мантисы – цивилизация разумных богомолов. Впервые была обнаружена людьми, как первая инопланетная нация. Миром управляет королева-матка, а быстро растущее число населения заставляет их искать новые миры для колонизации, из-за чего часто приходится воевать.
• Селареоны – малоизвестная раса, появившаяся из чистой энергии. Обитают в металлических контейнерах после проклятия божественных существ. Их исследования позволяют собственноручно проектировать червоточины для быстрого путешествия по космосу.