Total War Saga: FALL OF THE SAMURAI показывает кровавую войну между воинами феодальной Японии и мощным оружием следующей эпохи. Действие игры происходит спустя 400 лет после предыдущей SHOGUN 2. Страна восходящего солнца переходит в эру технологий и затевает жестокие военные действия, в то время как Соединенные Штаты, Англия и Франция прибывают на их территории, чтобы поддержать конфликт.

История стартует в 1864 году. В стране разгорается вражда Босин, вызванная недовольством навязывания культуры со стороны стран Запада. Чтобы им противостоять, страна переходит в промышленный период. Это сильно бьет по национализму в рамках страны, что приводит к свержению сёгуната.Игрок волен выбирать сторону конфликта, представленные кланами:

• Император - Тёсю, Сацума, Тоса;
• Сёгунат - Айдзу, Нагаока, Дзёдзаи.

В конфликте также принимают участие: сторонники прогресса, управленцы, предатели и переговорщики. Каждый из данных кланов приносит свои бонусы, поскольку преследует личные цели. К примеру, сторонники прогресса имеют тесные связи с Западом, поэтому имеют доступ к их оружию и продовольствию. Предатели - ловкие и хитроумные ниндзя, способные участвовать в диверсиях и строить коварную стратегию против врага.

Геймплей ярко отражает народные настроения Японии XIX века. Войско Западных держав играют не последнюю роль в сюжете. Какие связи и отношения выбирает игрок с этими странами -зависит набор юнитов и вооружение, которым будут обеспечивать игрока союзные страны.Стратегия покажет не только кровопролитную войну, но и продемонстрирует столкновение различных культур и политических взглядов. При этом визуальная сторона игры пытается подчеркнуть все нюансы японской религии и культуры.