Gunpoint переносит пользователя в недалекое будущее, где изобрели немало интересных шпионских вещей. Ричард Конвей работает шпионом по найму, выполняя самые разные задачи. Однажды к нему попадает особый экземпляр - гиперштаны. Этот элемент одежды помогает в прыжке преодолевать огромные расстояния, а также без вреда для здоровья падать с высоты. Протагонист получает новое задание - расследовать убийство сотрудницы компании по производству оружия. Парень должен разобраться в обстоятельствах странного преступления.

Прохождение Линии Огня состоит из разных миссий. Задания здесь разнообразные, например, нужно проникнуть на территорию, находящуюся под охраной, похитить или заменить либо перепрограммировать любую информацию. Сооружения имеют вид в разрезе, поэтому игрок видит охранников и расположение нужного терминала. Протагонист способен прыгать на расстояние и даже запрыгивать на верхние этажи, а также может карабкаться по стенам и потолку. В процессе эти навыки стоит прокачивать и приобретать полезные гаджеты, например, умение перенастраивать оружие противника или разбивать окна без соответствующих звуков.

Ричард умеет работать с терминалами удаленно и проникать в разные устройства здания, изменяя их работу. Таким образом, при включении света может открыться дверь, а попав в обзор камеры слежения, не включится тревога, а приедет лифт. В качестве препятствий здесь выступает охрана и запертые двери. От первых стоит прятаться и отвлекать их при помощи перепрограммирования приборов, а также оглушить, подкравшись сзади. А отпереть замок можно заставить охранника или поменять предназначения кнопок.