В Thymesia игрок берёт управление над загадочным Корвусом. События разворачиваются в вымышленном королевстве, где правит смерть и разбойники. Главный герой выслеживает противников и устраняет их. Корвус получил силу чумы, смертоносные заклинания, которые помогут добраться до правды в стране. Ранее королевство процветало, а жизнь пела светлыми красками. Правитель решает попытаться запретить темное дело в алхимии, а после этого следуют катастрофические события. Спустя несколько дней государство охватывает хаос, монстры вылезают из-под земли и убивают мирных жителей.

Протагонист утратил память, но только восстановив её он сможет разузнать, откуда взялись чудища и как их уничтожить. Исследуя мир и выполняя задания, центральный персонаж открывает собственные утраченные воспоминания, разгадывая тайны. Подопечный научился применять силу врагов против них. Уничтожение боссов или обычных приспешников делает Корвуса только сильнее. Сила болезни применяется против каждого оппонента и помогает быстро его устранять. В сражениях геймер способен воспользоваться холодным оружием и умениями персонажа. Постепенно герой откроет больше навыков и вооружения. Юзер выстроит оригинальный стиль боя и сможет преодолевать трудности разными способами.