Действие Mushihimesama разворачивается в диком и незапятнанном мире с обширными пустынными территориями, постепенно превращающимися в густые леса. Здесь обитают членистоногие Кодзую, звери-насекомые. Как только они погибают, то вокруг области их смерти все обрастает растительностью, что позволяет создать естественный цикл жизни и смерти. Данная раса обладает жизненной силой Levi-Sense, которая оказалась для людей невероятно ядовитой и ее назвали миазмами.

Лишь немногочисленным населенным территориям было разрешено жить, но в обмен на маленькую 15-летнюю девочку каждые 200 лет. Реко – дочь королевской семьи и она получила загадочный подарок от мальчика, из-за чего она стала следующей, кого предстоит отдать. Когда ей исполняется 15, миазмы поражают деревню. Чтобы спасти свое государство, она возвращается в лес Синдзю при помощи золотого жука Кодзю Киниро, с которыми она имеет телепатическую связь. Героиня желает добраться до самого бога, чтобы предотвратить гибель своего поселения.

Игрок будет исследовать фантастический мир, сражаться с многочисленными гигантскими жуками, чтобы пройти через 5 этапов: пылающую пустыню, густые леса и безмятежную пещеру. В геймплее включено несколько режимов: аркадный, новичок, Arrange и бесконечный. Пользователь способен воспользоваться 3 типами вооружениями и второстепенными опциями, чтобы убивать врагов на уровнях.